Со временем, когда этот обряд, окончательно сформировался и стал официально судебной частью, например для казни, то он немного видоизменялся и добавлялся моментом обезглавливания.
Это, один из важных этапов, который состоял в том, что помощник(кайсякау) вынужденного самоубийцы, обычно один из друзей, либо равный по рангу воин или специальный человек назначенный властью, одним ударом меча отрубал ему в нужный момент голову. Обезглавливание не выполнялось до того момента, пока туловище самоубийцы не начинало наклоняться в перед, таким образом самурай показывал силу своего духа(хара) и стоически терпел мучения.
В случае когда харакири совершали лица, которые были буйны и настолько опасны или им не доверяли, то вместо оружия был веер. Самоубийца касался своего живота веером, и в этот момент помощник обезглавливал его.
Среди других этапов в самоубийственном ритуале, обреченные самураи перед сэппуку, часто пили саке и сочиняли предсмертное короткое стихотворение в жанре «вака».
Основной смыслом сэппуку для самураев, было отстаивания чести, завоевать уважение, избежать позора и добиться почетной смерти. Первое сэппуку зародилось на поле боя, одним из элитных самураев(дайме), во избежания плена и позора. Но в дальнейшем этот ритуал стал многозначительным и поводами для сэппуку стали служить самые ничтожные причины, например как средство протеста или выразить скорбь по поводу смерти почитаемого лидера.
С начала XIV века, сэппуку превратилось в распространенный вид высшей меры наказания для самураев, совершивших позорные преступления. В каждом случае, это считалось актом храбрости и самопожертвования в котором олицетворяли «бусидо», древний кодекс самурая, кодекса чести.
Существовал даже женский вариант сэппуку, назывался «дзигай», но женщины уже не вспарывали себе живот как мужчины, а перерезали горло, используя специальный нож(танто).
Одним из самых ярких примеров в истории самураев, следования кодекса чести(бусидо), является всем знакомое событие о «47 ронинов». История 17-го века, о верных и преданных войнах, которые - после падения дома своего господина(Асано Наганори), посвятили свою жизнь, мести за него.
Асано Наганори принял смерть через сэппуку, за нападение на чиновника в ответ на оскорбления и издевательства со стороны последнего. Потеряв своего господина, сорок семь ронинов во главе с советником Оиси Кураносукэ, дали клятву отомстить за смерть, несмотря на то, что их за это ождал смертный приговор.
Выбрав нужный момент, они напали на дом Кира Еситака, виновного в смерти их господина, и отрубили ему голову. Этот случай, стал одним из примеров стойкости и преданности, самурайской чести, а также кодекса бусидо. Именно поэтому, не смотря на то, что они совершили одно из самых серьезных преступлений по самурайским законам, им было даровано смерть через сэппуку.
Конец популяризации сэппуку приходится на конец 19-го века, после реставрации Мэйдзи, перехода системы власти от самураев(сегуната), к императору и правительству. Под давлением новых идей, изменение всех идеологических и нравственных целей, официальное применение сэппуку в конце концов было отменено, но на практике не исчезло полностью.
Примечательно, что Тосиакира Кавадзи(один из подписавших «Симодский трактат»), после реставрации Мэйдзи, покончил с собой в знак преданности своей к сегуну, но из за предрасположенности к реформам, сделал это из револьвера, застрелившись.
Одними из ярких проявлений кодекса бусидо последних столетий, является период Второй Мировой, когда пилоты-смертники(камикадзе), шли на таран ценою своей жизни, а когда Япония подписала акт о капитуляции, тысячи японских офицеров и солдат сделали себе сэппуку.
